液色色谱-质谱联用仪适合于亲水性强难挥发性有机物、热不稳定化合物、生物大分子等的定性、定量分析，也用于未知物分子量、结构式的测定等工作；主要应用于食品分析、药物分析、环境分析和化工产品分析等领域。